神戸のとある高校に転校してきた主人公は「ミニマム」という特殊能力を持つ「トラブルバスターズ」と出会い、 ある事件をきっかけに自分も「ミニマムホルダー」であると知る。
「トラブルバスターズ」のもとにはさまざまな依頼が寄せられ、 その中には記憶を失った人々にまつわる依頼も。
事件を解決していくうちに神戸の街を蝕む陰謀が姿を現し、 「ミニマムホルダー」の謎も明らかになっていく…。